Le Conseil de la commune ecclésiastique de Fontenais-Villars est l'autorité exécutive et administrative de la paroisse catholique de Fontenais-Villars. Il doit s’acquitter des attributions et obligations qui lui sont déléguées par la Collectivité ecclésiastique cantonale (CEC).

Sa responsabilité s'articule avec celle de l' Equipe pastorale qui a la charge de conduire la communauté et du CdOp qui porte le souci de la vie pastorale de la communauté.

Le Conseil étudie, évalue et régit les besoins logistiques nécessaires à l'activité pastorale. Il organise les assemblées de paroisse.